慢性莱姆病与 DNA 研究

NutriGenetic Research Institute 很高兴分享其关于遗传学与慢性莱姆病的多阶段研究。

第一阶段 – 2016年6月 – 获奖
《在慢性莱姆病患者中发现更高水平的基因变异（SNP）》
主讲人：Bob Miller，CTN 至在芬兰赫尔辛基举行的第6届欧洲会议上的国际莱姆病及相关疾病协会（ILADS）

摘要：来自世界各地的192名参与者自愿提交了他们的基因组，与1000基因组第3阶段计划提供的数据进行全球对照。参与者的基因组通过 23andMe 提供的分析进行评估。我们检查了350个参与线粒体功能、甲基化、神经递质生成、抗氧化生成，以及可能导致氧化应激（包括超氧化物、谷氨酸、氨和过氧化亚硝酸根）过度生成的基因。收集的数据表明，慢性莱姆病患者体内可能存在独特的基因变异。补偿这些变异以降低铁氧化并改善甲基化，可能对慢性莱姆病患者是一种有益的疗法。

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第二阶段 – 2016年11月
《在慢性莱姆病患者中发现更高水平的基因变异（SNP）》
主讲：由 Bob Miller（CTN）2020 环境毒素与基因组学霉菌毒素会议录像

摘要：为确定慢性莱姆病患者是否具有可能产生过度炎症或抑制免疫系统的独特基因模式，NutriGenetic Research Institute 将一组360名自称患有慢性莱姆病的个体的1298个基因，与1000基因组第3阶段计划提供的数据进行了对比。各 SNP（单核苷酸多态性）的参考和替代等位基因均使用 HaploReg v4.1 数据库确定。公式确定了在慢性莱姆病患者中比对照组变异更多的65个主要基因。其中神经递质基因占了前65个变异最多基因中的40个。本分析将重点关注谷氨酸、多巴胺和大麻素 SNP。

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第三阶段 – 2017年5月
《在慢性莱姆病患者中发现更高水平的基因变异（SNP）》
主讲：由 Bob Miller（CTN）在法国巴黎举行的第7届欧洲会议上的 ILADS

摘要：基因变异（SNP）可导致自由基增加、有毒物质增多以及抗氧化保护下降，从而引起解毒困难与免疫系统削弱，使莱姆病可能对传统治疗产生耐药。为验证这一假说，来自世界各地的391名自述患有慢性莱姆病的参与者自愿提交了他们由 23andMe 提供的分析基因组，与1000基因组计划提供的数据进行全球对照。我们评估了那些一旦发生变异就会升高铁水平、降低身体抗氧化能力的基因。各 SNP 的参考等位基因和替代等位基因均使用 HaploReg v4.1 数据库确定。随后将数据与1000基因组第3阶段计划的数据进行对比，并计算慢性莱姆病组与基因组计划研究之间 SNP 的比例。

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第四阶段 – 2017年11月
《慢性莱姆病患者中与自噬减少和 mTOR 增加相关的基因变异增多》
主讲：由 Bob Miller（CTN）与 Matthew Miller 在马萨诸塞州波士顿举行的第18届年度科学会议上向 ILADS 提交

摘要：部分莱姆病患者因炎症和解毒困难而对治疗反应不佳。自噬通过回收旧细胞并清除病毒、细菌、霉菌和有毒物质来支持解毒[1]。  雷帕霉素的机制性靶点（mTOR）将细胞生长与细胞的生长因子、营养素和能量状态相协调。因此，它增加能量生产，但也会产生产生需要被清除的物质。自噬有助于清除细胞内所有不可逆氧化的生物分子（蛋白质、DNA 和脂质）。然而，当 mTOR 降低时，自噬最为活跃[2]。激素（异雌激素、乳制品和肉类）、生长因子（乳制品和肉类）、铁（富铁食物）、谷氨酸（味精和杀虫剂）、胰岛素（高糖食物）、电磁场、亮氨酸、精氨酸和叶酸都会刺激 mTOR，而这些物质在食物供应和环境中都更加普遍。因此，环境因素、内源性状况和基因变异都可能导致 mTOR 活性升高和自噬降低。据预测，在被诊断患有慢性莱姆病的个体中，可能会发现更多与 mTOR 和自噬相关的基因变异。为验证这一假说，391名莱姆病患者提交了他们由 23andMe 提供的基因组，与1000基因组计划进行对照[3]。我们评估了那些一旦发生变异就会刺激 mTOR 并抑制自噬的基因。各 SNP 的参考和替代等位基因均使用 HaploReg v4.1 数据库确定[4]。计算了慢性莱姆病组与基因组计划组之间 SNP 的比例。基因分析发现，受表观遗传因素刺激 mTOR 的基因以及支持自噬的基因中变异增多。

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第五阶段 – 2018年6月
《在慢性莱姆病患者乙酰化与脂质合成基因中发现的基因变异增加》
主讲：由 Bob Miller（CTN）在波兰华沙举行的第8届欧洲会议上的 ILADS

摘要：部分莱姆病患者对治疗反应不佳：有假说认为这可能与解毒困难和炎症有关。塑料、工业化学品、药物、杀虫剂、香料和环境污染物等外来化合物需要由身体进行解毒[1]。需要 I 期 CYP450 酶和 II 期结合通路通过尿液、胆汁和粪便清除这些毒素[2]。蛋白质乙酰化与去乙酰化之间的平衡在基因表达、信号通路的调控中发挥关键作用，并影响大量与解毒相关的细胞过程。乙酰化是通过 N-乙酰转移酶（NAT）将乙酰基官能团（乙酰辅酶A）引入化合物的II相结合反应过程。乙酰化可在表观遗传层面改变基因表达。乙酰化是外来化合物代谢的重要途径[3]。去乙酰化是去除乙酰基。要正常进行乙酰化，需要有充足的乙酰辅酶A供应。PANK 基因负责催化泛酸（维生素B5）的 ATP 依赖性磷酸化，生成 4′-磷酸泛酸，而这是生成充足乙酰辅酶A 所必需的[4]。NAT 酶负责对外来化合物进行乙酰化[5]。乙酰辅酶A 也是 Nrf2 和 ARE（抗氧化反应元件）表达所必需的，后者生成用于外来化合物结合的谷胱甘肽[6]。ACAT2 基因是参与脂质代谢的酶，其结果是生成激素、DHEA 和皮质醇[7].

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第六阶段 – 2018年11月 – 获奖
《慢性莱姆病患者血红素通路与肥大细胞基因中发现的基因变异增加》
主讲：由 Bob Miller（CTN）在伊利诺伊州芝加哥举行的2018年年会上的 ILADS

摘要：部分莱姆病患者对治疗反应不佳，有假说认为这可能与解毒困难有关。血红素蛋白不仅在血红蛋白生成中起重要作用，还通过促进胆红素的生成、支持 SUOX（亚硫酸盐转化为硫酸盐）、NOS（一氧化氮合酶）、NADPH（支持抗氧化循环）和 GSH（谷胱甘肽）来发挥重要的抗氧化保护作用。正常的血红素生成包含七个步骤，每一步都由特定的酶和辅因子调控。ALAD、CPOX 和 FECH 酶对血红素合成至关重要，而 HMOX 催化血红素降解，负责多种与控制炎症相关的关键过程。肥大细胞在体内扮演重要角色，但过度活跃时则有害。KIT、RAD50、HRH1、FCER1A 和 DARC 基因与肥大细胞活性及对肥大细胞活化的反应相关。本研究旨在评估耐药莱姆病患者是否在参与血红素生成、利用及肥大细胞活化的基因中表现出更多变异。421名莱姆病患者提交了他们由 23andMe 提供的基因组，与1000基因组计划进行对照。各 SNP 的主要和次要等位基因均依据1000基因组计划确定。研究计算了慢性莱姆病组与基因组计划组之间 SNP 的比例。

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第七阶段 – 2019年6月
《莱姆病患者中与 NAD+ 和 NADPH 的生成及利用相关的基因变异增加》
主讲人：Bob Miller，CTN在西班牙马德里举行的2019年第8届欧洲会议上的 ILADS

摘要：环境毒性日益成为研究的焦点，因为越来越多的证据表明环境毒素对免疫系统具有累积效应，并造成毒性超载，使清除病原体更具挑战性。在清除环境毒素中起关键作用的是 NAD+ 和 NADPH 分子。
NAD+ 在支持以下方面发挥关键作用：

– 支持 DNA 修复的 PARP 酶[1].

– SIRT3 酶支持与长寿相关的 FOXO3 基因，有助于生成关键抗氧化剂超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化氢酶，并支持自噬——这是一个清除死亡细胞、毒素和病原体的重要过程。SIRT3 还支持尿素循环、NADPH 的生成以及线粒体内的能量创造[2,3,4].

– SIRT1 酶支持维生素 D 受体、超氧化物歧化酶并减缓 mTOR。这一点很重要，因为 mTOR 抑制自噬，过量时会促进炎症[5,6,7].

– NADPH 的生成，该分子负责将氧化的谷胱甘肽和硫氧还蛋白还原回还原态，是一氧化氮生成的辅助因子，也是 Krebs 循环中产生能量所必需的[8,9,10]。NADPH 缺乏会阻碍关键的 II 期解毒通路——谷胱甘肽结合，并使氧化的谷胱甘肽产生超氧化物和过氧化亚硝酸根等自由基[11,12].

为确定慢性莱姆病患者体内是否存在 NAD+ 和 NADPH 方面的独特基因模式，我们分析了421名参与者提交的功能与解毒通路基因模式，这些参与者的 23andMe 基因组与1000基因组第3阶段计划的数据进行了全球对照。各 SNP 的参考和替代等位基因均使用 HaploReg v4.1 数据库确定。随后比较了慢性莱姆病组与1000基因组数据之间，与抗氧化生成、自由基过度生成、I期和II期通路以及自噬相关通路中 SNP 的比例。